In het HBD werken ondernemers- en werknemersorganisaties samen. Deze organisaties vormen ook het bestuur. Hierdoor is gegarandeerd dat beleid en activiteiten van het HBD steeds worden getoetst aan de belangen van ondernemers en werknemers in de sector.
De organisaties die in het Hoofdbedrijfschap Detailhandel (HBD) samenwerken zijn:
Het bestuur laat zich beleidsmatig adviseren door vijf adviescommissies, te weten:
Daarnaast kent het HBD een Financiële Commissie en een Auditcommissie (deze houdt toezicht op de uitvoering van de Code Goed Bestuur).